Mitos y conceptos erróneos sobre el microbioma humano

Entre las erratas incrustadas se encuentran las 'bacterias malas', su número y peso y una 'firma bacteriana' de la obesidad, según una nueva perspectiva publicada en Nature.

Por Ruth Schuster / Haaretz

Israel, a 1 de agosto del 2023.- Piense un momento en sus bacterias. Rara vez una forma de vida se ha vuelto tan incomprendida como los gérmenes en tu intestino. Los microbios difamados se han convertido en objeto de mitos y conceptos erróneos persistentes, incluso en el contexto de la lucha contra la obesidad. Pero la literatura sobre el microbioma humano está plagada de suposiciones e inexactitudes, según un artículo de perspectiva publicado el lunes en Nature Microbiology por Alan Walker de la Universidad de Aberdeen en Escocia y Lesley Hoyles de la Universidad de Nottingham Trent en Inglaterra. Y simplificaciones excesivas.

El microbioma humano se refiere a la totalidad de todos los microorganismos, bacterianos y de otro tipo, que viven comensalmente en su ser. Walker y Hoyles llaman la atención sobre 12 imprecisiones comunes que se han arraigado debido a la explosión de la investigación sobre el tema, oa pesar de ella. El mero aumento de la actividad trajo consigo "un grado de exageración y desinformación", advierten.

la fea bacteria

Comencemos con suposiciones irreflexivas. Un microbio no es bueno ni malo, como ningún animal es feo. Son proclamaciones sentenciosas, acientíficas y especistas en el mejor de los casos. “Los microorganismos y sus metabolitos no son ni 'buenos' ni 'malos', simplemente existen”, señalan los autores.

La falacia del microbio bueno/malo conduce a la idea errónea de que la mayoría de las enfermedades se caracterizan por un "patobioma", un término que no está claramente definido. Algunas enfermedades se han correlacionado con cambios en nuestros huéspedes microbianos, pero la mayoría, ¿o incluso muchas? La forma en que los microbios nos afectan a nosotros, los anfitriones, es a menudo una cuestión de contexto.

Tome Escherichia coli (E. coli), una bacteria intestinal normal que causa problemas si ingresa a la uretra o al torrente sanguíneo. O tomemos Clostridioides difficile , anteriormente conocido como Clostridium: como E. coli, está en todas partes, y uno puede albergar este germen sin darse cuenta hasta que se vuelve inmunocomprometido o toma antibióticos que matan las bacterias con las que C. difficile compite en sus entrañas. Entonces puede causar diarrea e inflamación del colon, incluso de manera fatal .

¿Entonces? Entonces, no es un error bueno o malo, solo una cuestión de contexto y pensamiento confuso que no se presta a una práctica médica efectiva.

Disbiosis y el bebé

Los cambios en nuestras poblaciones de microbios pueden correlacionarse con varias condiciones, pero el término resultante "disbiosis" es otro confuso con aplicabilidad clínica limitada, argumentan los autores. Las personas varían enormemente en sus bacterias; es "extremadamente difícil" precisar configuraciones de microbios con la especificidad y reproducibilidad requeridas para la práctica clínica, por decirlo suavemente. La cantidad de parámetros que afectan nuestra salud, desde la edad hasta el índice de grasa , el tabaquismo y los hábitos alimenticios, es ingente. En resumen, la investigación no ha demostrado que "la mayoría" de las enfermedades se caractericen por un determinado "patobioma".

A propósito de la explosión de la investigación, los últimos 15 años han traído una gran cantidad de nuevos estudios, dicen los autores, pero señalan que las bacterias han estado bajo investigación desde su descubrimiento en el siglo XIX; en ese sentido, esta investigación no es "nueva". ” E. coli, por ejemplo, se identificó en 1885. También desacreditan la noción de que la palabra "microbioma" fue acuñada por el premio Nobel Joshua Lederberg en 2001; Si bien eso aparentemente importa poco, señalan que este concepto erróneo común muestra cuán fácilmente pueden afianzarse las falsedades.

Entre la masa sin sentido de minucias, los autores notan la creencia generalizada de que el microbioma humano pesa de 1 a 2 kilogramos; los autores ni siquiera pueden identificar dónde surgió esta falacia y, de hecho, no existe tal medida. Estiman que el peso de nuestras bacterias es de unos 500 gramos como máximo (excepto quizás entre los que padecen estreñimiento severo).

Lo que lleva a otra pizca: que nuestras bacterias superan en número a nuestras células por 10 a 1. Aquí rastrearon la fuente, un cálculo casual en la década de 1970, pero en cualquier caso, diferiría enormemente de una persona a otra y la cifra real, “aunque sigue siendo impresionante”, escriben, probablemente esté más cerca de 1:1, y eso se aplica a la gente de la ciudad. Quién sabe lo que pasa ahí fuera en los palos. O en bebés.

No, los bebés no obtienen sus bacterias intestinales directamente de la madre, escriben Hoyles y Walker. Obtenemos algunas bacterias de la madre y gran parte de ellas se arrastran por la tierra: "la mayor parte de la expansión de la diversidad de la microbiota intestinal ocurre después del nacimiento, durante los primeros años de vida, y aumenta de manera más dramática después del destete", escriben los autores. Señalan amablemente que cada adulto tiene su propia configuración de microbiota única, incluso los gemelos idénticos criados en el mismo hogar.

la rata gorda

Lo que nos lleva a la obesidad. Se ha afirmado y aún se afirma a menudo que la proporción de dos grupos principales de bacterias intestinales, firmicutes y bacteroidetes, cambia en los obesos, escriben los autores. Esto ha llevado a sugerir que volver a cambiar la proporción podría ayudar a combatir la obesidad.

De hecho, un artículo de 2020 escribe que "generalmente se observa una relación F/B aumentada con la obesidad" y una relación disminuida se considera "disbiosis", que, como señalan Walker y Hoyles, es un término confuso.

La creencia de que la proporción de firmicutes y bacteroidetes afecta nuestra salud se basa principalmente en la investigación con roedores (como en el Instituto Weizmann de Israel ) y no ha demostrado ser fácilmente reproducible en estudios con humanos, advierten Walker y Hoyles.

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“Al igual que con muchos otros estudios que informan vínculos entre perfiles de microbiota específicos y enfermedades, la reproducibilidad es deficiente”, escriben los autores. "De hecho, ahora ha habido al menos tres metanálisis que informan que este hallazgo es inconsistente entre los estudios en humanos y que, de hecho, no hay firmas taxonómicas microbianas reproducibles de obesidad en humanos".

Es decir, no, la investigación no ha determinado una correlación entre nuestras bacterias y nuestra obesidad. A propósito de lo cual, parece que incluso la obesidad no se entiende claramente: un nuevo estudio israelí publicado en julio encontró que un tercio de los adultos israelíes de "peso normal", con un IMC (índice de masa corporal) de "rango normal", en realidad son clínicamente obesos según la medida de su tejido graso. Lo cual es un eufemismo por estar terriblemente fuera de forma incluso si su peso parece normal.

También observamos que, si bien nuestro microbioma desempeña un papel en nuestra salud, si no es que es terriblemente claro, tomar antibióticos es muy complicado. Tenga en cuenta nuevamente cómo puede abrir la puerta a Clostridioides difficile. En un artículo de 2022 sobre el impacto de los antibióticos en el bioma , describe el problema y agrega que "en los bebés, la microbiota intestinal se adquiere durante el nacimiento", pero eso es un concepto erróneo según Walker y Hoyles.

En el contexto de tratar de vincular nuestros microbios y nosotros mismos, Walker y Hoyles señalan la "tendencia inútil" de examinar la microbiota en niveles de clasificación muy amplios de secuenciación genética, que es tan útil como agrupar un chorro de mar con un cocodrilo y un elefante: todos son cordados, por lo que todos son iguales, ¿no?

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Los autores también explican la falacia de los llamados a una metodología única para estudiar el microbioma humano: “La verdad es que el 'mejor' método depende fundamentalmente de la estructura subyacente de la comunidad microbiana en una muestra determinada, y esto puede variar enormemente entre individuos. y entre sitios del cuerpo”, resumen.

Entonces, ¿qué tenemos? Muchas bacterias y bastante menos claridad. Muchas ideas interesantes que necesitan más trabajo. En este punto, la investigación sobre las correlaciones o causas entre las bacterias intestinales y la obesidad y el bienestar aún es joven. También debemos tener en cuenta que lo que se aplica a las ratas puede no aplicarse a los humanos, y las suposiciones infundadas no son una base útil para asignar recursos de investigación finitos. En cuanto a nosotros, los laicos, caveat emptor.